贺兰山

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10月份的著名期刊里面有这些研究值得学习 [复制链接]

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年10月份刚刚结束了,10月份Cell和Science期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?

1.Cell:开发出光学混合筛选技术,可在几天内筛选人细胞中的数千个基因

doi:10./j.cell..09.

如今,在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院和布罗德研究所的研究人员开发出一种方法,该方法将大规模混合筛选与基于图像的细胞行为分析相结合。这种称为光学混合筛选(opticalpooledscreen)的方法允许人们在空间和时间分辨率下研究基因如何影响细胞过程,而其他的混合筛选方法则无法做到这一点。相关研究结果发表在年10月17日的Cell期刊上,论文标题为“OpticalPooledScreensinHumanCells”。论文通讯作者为布罗德研究所核心研究所成员、麻省理工学院生物工程系副教授PaulBlainey博士。论文第一作者为Blainey实验室博士后研究员AvtarSingh和Blainey实验室物前理学博士生DavidFeldman。基因编辑大牛张锋(FengZhang)也是这篇论文的共同作者。

图片来自Cell,,doi:10./j.cell..09.

Singh说,“通过这种新方法,任何人都可以在无需专门设备的情况下使用显微镜在几天内筛查数千个基因。”

这些研究人员通过对数百万个细胞中一种称为p65的蛋白的细胞位置进行成像,研究了个基因对一种称为NF-kB的免疫调节复合物的信号转导活性的影响。他们发现了两个基因---MED12和MED24---在NFkB信号弛豫过程中的新作用。

2.Science:新研究揭示人类微生物组是潜力巨大的新型抗菌药物聚宝盆

doi:10./science.aax

就像淘金热中的淘金者曾经在北加州的山上开采这种闪亮的贵金属一样,“生物勘探者(bioprospector)”也在寻找新的奖项:潜在的抗菌分子,而且他们正在人类微生物组(microbiome)中寻找它们。近二十年来,科学家们一直在揭开将人体作为家园的这些微生物群落的神秘面纱。如今,他们将人类微生物组视为一种未开发的分子来源,所提供的分子可能有助于抗击感染并且有可能治疗其他疾病。

在一项新的研究中,美国普林斯顿大学的YukiSugimoto博士及其同事们将生物信息学与合成生物学相结合,鉴定出具有类似药物功能的生物活性小分子。通过使用他们的新计算算法,他们能够阐明潜在有效抗菌分子的DNA指纹。相关研究结果近期发表在Science期刊上,论文标题为“Ametagenomicstrategyforharnessingthechemicalrepertoireofthehumanmicrobiome”。论文通讯作者为普林斯顿大学分子生物学家MohamedDonia。Sugimoto是Donia实验室的博士后研究员。

图片来自CC0PublicDomain

Sugimoto及其同事们将人类微生物组描述为鉴定新药化学结构的一种无与伦比的资源。他们在这篇论文中写道:“我们发现,临床上使用的一类分子的成员广泛地编码在人类微生物组中,而且它们对邻近的微生物发挥着有效的抗菌作用。我们的方法为系统性揭示人类微生物组编码的化学分子库铺平了道路。”

在寻找过程中,这些研究人员依靠他们定制的方法,这是一种计算机算法,可让他们搜索大量的分子片段。这种称为MetaBGC(metagenomebiosyntheticgenecluster,宏基因组生物合成基因簇)的生物信息学方法使得他们能够发现来自人类微生物组的之前从未报道过的分子。他们着重

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